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Text File  |  1995-03-04  |  3.7 KB  |  83 lines
  1. ***************************************************
  2. * G-protein coupled receptors family 2 signatures *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. A number of peptide hormones bind to  G-protein coupled  receptors that, while
  6. structurally similar to the majority of G-protein coupled receptors (R7G) (see
  7. the relevant  section),  do  not  show  any  similarity  at the level of their
  8. sequence, thus  representing  a  new  family  whose  current known members are
  9. listed below:
  10.  
  11.  - Calcitonin [1].
  12.  - Corticotropin Releasing Factor [2].
  13.  - Glucagon [3].
  14.  - Glucagon-like peptide 1 [4].
  15.  - Growth hormone-releasing hormone [5].
  16.  - Parathyroid hormone / parathyroid hormone-related peptide [6].
  17.  - Pituitary adenylate cyclase activating polypeptide [7].
  18.  - Secretin [8].
  19.  - Vasoactive intestinal peptide [7].
  20.  - Manduca sexta diuretic hormone [9].
  21.  - Caenorhabditis elegans putative receptor ZK643.3.
  22.  
  23. All these receptors  are  coupled to  G-proteins  which activate both adenylyl
  24. cyclase and the phosphatidylinositol-calcium pathway.
  25.  
  26. Like classical R7G they  seem  to  contain seven transmembrane regions.  Their
  27. N-terminus is probably located on the extracellular side of the  membrane  and
  28. potentially glycosylated, while their C-terminus is probably cytoplasmic.  But
  29. apart from these topological similarities they do share any region of sequence
  30. similarity and are therefore probably not evolutionary related.
  31.  
  32. Every receptor  gene  in this family is encoded on multiple exons, and several
  33. of these  genes  are  alternatively  spliced  to  yield  functionally distinct
  34. products.
  35.  
  36. The N-terminal extracellular domain of these receptors contains five conserved
  37. cysteines  residues  which  could  be  involved in  disulfide  bonds;  we have
  38. developed a pattern in the region that spans the first three cysteines.
  39.  
  40. One of the most highly conserved regions spans the C-terminal part of the last
  41. transmembrane  region and the  beginning of the adjacent intracellular region.
  42. We have used this region as a second signature pattern.
  43.  
  44. -Consensus pattern: C-x(3)-[FWV]-D-x(3,4)-C-[FW]-x(10,12)-C-[PF]
  45. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  46. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  47.  
  48. -Consensus pattern: Q-G-[LIVMFY]-[LIVMFYT]-V-[AS]-[LIVMFYT]-[LIVMFY](2)-C-
  49.                     [FY]-x-N-x(2)-V
  50. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  51. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  52.  
  53. -Expert(s) to contact by email: Kolakowski L.F. Jr.
  54.                                 lfk@receptor.mgh.harvard.edu
  55.  
  56. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  57.  
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